□本报记者 汤江峰
8月2日,湖南省疾控中心发布通报,该中心完成20例德尔塔新冠病毒基因组测序,测序结果和南京疫情本土病例新冠病毒基因组序列高度同源,并得到中国疾控中心反馈结果的确认。
这份报告源于新冠病毒溯源的“亲子鉴定”——基因测序。因而,有关“基因测序”关键词,成为公众茶余饭后的话题。
生活中常见的亲子鉴定,就是应用基因测序技术,通过DNA检测分析,来判定有争议的父母与子女之间是否有亲生关系。DNA是人类遗传的基本载体,DNA遗传标记通过遗传终身不变。DNA存在于细胞核内的染色体上,人体约有30亿个核苷酸 构成整个染色体系统,而且,在生殖细胞形成前的互换和组合是随机的。所以,除同卵双胞胎以外,没有任何两个人具有完全相同的核苷酸序列。
目前,基因测序广为人知的有针对唐氏综合征的无创产前基因检测,只需要采集孕妇的外周血,通过对血液中游离DNA进行测序,并将测序结果进行生物学分析,从而得出胎儿是否患有染色体数目异常的疾病。
那么,什么是基因测序?它有什么意义呢?8月3日,记者采访了湖南省疾控中心微检科科长湛志飞。他说:“基因测序是一种新型基因检测技术,能够从血液或唾液中分析测定基因全序列,锁定个人病变基因,预测罹患多种疾病的可能性,提前预防和治疗。而且,基因测序,可在第一时间获取新发未知病毒的基因组序列信息,通过构建进化树,研究不同患者病毒遗传序列变化,能在分子生物学层面揭示病毒的传播方式,分析新冠病毒的进化来源,研究新冠病毒的致病病理机制,为控制疫情暴发提供科学依据。”
今年7月28日,湖南省疾控中心接到今年首例本土新冠肺炎病例标本后,就马上展开标本基因组测序。通过检测新冠病毒的全基因组序列,再将这个序列通过生物信息学分析,与数据库中的数据进行比对,可初步判断其地域来源。同时,将序列与既往病例序列进行比对,查看有无变异位点。如果序列在同一进化树分支上,则可以提示这些病例可能来自同一传播链,或传染源。
湛志飞介绍说,为确保结果科学精准,万无一失,他们接到阳性样本后,立即组织检验人员先复核,后提取核酸,再用两种试剂检测。复核阳性的标本,分别用先进的二代和三代高通量测序技术做序列测定,这样,就为病毒溯源设置了“双保险”。
目前,湖南省疾控中心已具备新冠病毒基因组高通量二代和三代测序能力,能为新型冠状病毒疫情以及其他传染病病原体的鉴定和溯源、防控应对提供强大的技术支撑。